En T-Systems, encontrarás proyectos rompedores que suman al bienestar social y ecológico. Queremos dar la bienvenida a nuevos talentos como tú, que aporten ideas frescas, puntos de vista distintos, que acepten retos y un continuo aprendizaje, para crecer e impactar a la sociedad… ¡Todo esto, de una forma divertida!
A continuación se detalla todo lo que necesita saber sobre lo que implica esta oportunidad, así como lo que se espera de los solicitantes.
Se trata de hacer un trabajo que importe para hacer avanzar a la sociedad. Por esta razón, haremos todo lo posible para asegurarnos de que tengas todas las posibilidades de desarrollo ofreciéndote una red de apoyo, excelente tecnología, un entorno de trabajo nuevo y la libertad de trabajar de forma autónoma. T-Systems somos un equipo de alrededor de 28 000 personas empleadas en todo el mundo, convirtiéndonos en uno de los principales proveedores mundiales de soluciones integradas de extremo a extremo. Desarrollamos soluciones de cloud híbrida, inteligencia artificial e impulsamos la transformación digital de las empresas, la industria, el sector público y en definitiva, de toda la sociedad.
Buscamos incorporar al área de Medicina de Precisión un/a Bioinformático/a Senior, con sólida experiencia en análisis de datos ómicos (especialmente genómica) y desarrollo de flujos de análisis reproducibles en Nextflow. Será responsable del diseño, desarrollo, optimización, validación y operación de pipelines bioinformáticos (WGS/WES, paneles, RNA-seq, etc.), garantizando calidad, trazabilidad, reproducibilidad, seguridad y escalabilidad.
Como Bioinformático/a Senior será responsable de:
Diseñar e implementar pipelines de análisis NGS end-to-end (QC, alineamiento, calling, anotación, priorización, reporting) para datos como FASTQ, BAM/CRAM, VCF/gVCF, y resultados derivados.
Desarrollar y mantener flujos de trabajo en Nextflow (DSL2), aplicando buenas prácticas (modularidad, perfiles, parámetros, pruebas, reusabilidad) y alineación con estándares tipo nf-core cuando aplique.
Containerizar pipelines (Docker/Singularity/Apptainer) y asegurar reproducibilidad a través de gestión de dependencias y versionado.
Desplegar/ejecutar pipelines en entornos HPC y/o cloud y optimizar rendimiento (paralelización, uso de recursos, caching, datos intermedios, costes).
Implementar mecanismos de trazabilidad, monitorización y alertas (logs, métricas, reporting de ejecución, control de calidad automatizado).
Colaborar con equipos de datos e infraestructura para operación en entornos Kubernetes/OpenShift/EKS y automatización mediante CI/CD.
Documentar flujos de análisis, supuestos, entradas/salidas, criterios de QC, limitaciones y versionado, facilitando transferencia de conocimiento al equipo y a usuarios clínicos/laboratorio.
Máster en Bioinformática (o equivalente) y base sólida en genómica/biología molecular aplicada a NGS.
~5+ años de experiencia en bioinformática (perfil Senior) desarrollando y operando pipelines de análisis en entornos de producción o regulados.
~ Experiencia demostrable en desarrollo de flujos de análisis con Nextflow (idealmente DSL2), incluyendo mantenimiento, parametrización y despliegue.
~ Sólidos conocimientos en Linux y scripting ( Bash ), y programación en Python (R valorable).
~ Dominio de formatos y estándares de datos genómicos: FASTQ, BAM/CRAM, VCF/gVCF, BED, GTF/GFF, y métricas de QC (cobertura, duplicados, sesgos, contaminación, etc.).
~ Experiencia con control de versiones (Git) y buenas prácticas de ingeniería (code review, testing, documentación).
~ Experiencia con contenedores (Docker y/o Singularity/Apptainer) y ejecución en HPC (SLURM u otros) y/o cloud.
~ Conocimiento de prácticas de calidad, trazabilidad, seguridad y cumplimiento en entornos de salud (p. ej., GDPR ), incluyendo manejo de datos sensibles.
Experiencia en genómica clínica (diagnóstico, interpretación de variantes, CNV/SV, farmacogenómica, cáncer somático/germinal).
Experiencia con nf-core (uso, adaptación o contribución) y/o estandarización de pipelines.
Conocimientos de CI/CD (GitLab CI/CD, Jenkins) aplicados a pipelines bioinformáticos (tests, linting, releases, versionado semántico).
Experiencia con workflow execution backends y optimización (AWS Batch, Kubernetes executor, Cromwell/Toil u otros, si aplica).
Conocimientos de Infraestructura como Código (IaC) y despliegue (Terraform, Helm) en coordinación con equipos de plataforma.
Conocimiento del dominio de datos ómicos, incluyendo genómica, transcriptómica y pipelines multi-ómica.
Integración entre plataformas de datos genómicos y LIS/HIS y flujos de laboratorio (molecular/NGS).
Experiencia con LIMS, trazabilidad de muestras y metadatos, y buenas prácticas de laboratorio computacional.
Modelos/estándares para investigación clínica o repositorios: i2b2, OMOP, CDISC ODM (según proyecto).
Experiencia en gobernanza del dato, anonimización/pseudonimización y estrategias de acceso seguro a datos.
Capacidad de trabajo en equipo y buena comunicación con perfiles mixtos (laboratorio, clínica, IT, datos).
Proactividad e iniciativa en la toma de decisiones técnicas (trade-offs, riesgos, calidad vs. tiempos).
Ambiente de trabajo internacional, positivo, dinámico y motivado.
~ Modelo de trabajo híbrido (teletrabajo/presencial).
~ Flexibilidad horaria.
~ Formación continua: Preparación certificaciones, acceso a Coursera, clases semanales de inglés y alemán...
~ Plan de compensación flexible: seguro médico, tickets restaurante, guardería, ayudas al transporte...
~ Más de 26 días laborables de vacaciones al año.
~ Fondo social. xqbhyrx
~ Si estás buscando un nuevo desafío, no dudes en enviarnos tu CV. ¡Únete a nuestro equipo!