Lead Bioinformático/a — Microbiota humana Advanced Health Systems · Barcelona / Remoto compatible
¿Tiene las habilidades necesarias para este puesto? Lea todos los detalles a continuación y presente su candidatura hoy mismo.
En Advanced Health Systems somos una Start-up basada en microbiota humana, con vocación regulatoria SaMD bajo MDR. Buscamos al perfil que asuma el liderazgo bioinformático del proyecto desde su fase fundacional.
Responsabilidades
- Diseñar, implementar y mantener los pipelines bioinformáticos de microbiota humana (16S y, en fase posterior, shotgun metagenomics) con criterios de reproducibilidad y trazabilidad.
- Co-arquitectar el Score Engine y el motor de recomendaciones junto al data scientist y al equipo científico.
- Coordinación directa con CTO en arquitectura de datos e interoperabilidad clínica (FHIR R4).
- Liderar las decisiones metodológicas críticas y defenderlas con argumentos científicos propios.
- Documentar con estándar de publicación y trazabilidad regulatoria.
Skills imprescindibles
- Programación científica productiva en Python y R (no solo notebooks). Git, control de versiones y testing no son opcionales.
- Pipelines tipo DADA2 / QIIME2 para amplicón. Familiaridad con shotgun metagenomics (Kraken2 / MetaPhlAn / HUMAnN) valorada.
- Manejo de bases de referencia taxonómicas y funcionales: SILVA, GTDB, KEGG, MetaCyc.
- Reproducibilidad: Nextflow o Snakemake, contenedores Docker.
- Cinco o más años de experiencia post-doctorado o equivalente industrial.
- Castellano fluido e inglés técnico.
Nociones imprescindibles en microbiota humana
- Experiencia demostrable con datos reales de microbioma humano (no ambiental, no modelo animal).
- Comprensión profunda de la composicionalidad de los datos microbianos y sus implicaciones estadísticas.
- Manejo de batch effects, sparsity, contaminación, y decisiones sobre rarefacción vs normalización.
- Conocimiento de índices de diversidad (Shannon, Simpson, Faith's PD) y transformaciones composicionales (CLR, ALR).
- Comprensión de los sesgos típicos del campo y capacidad de defender decisiones metodológicas con criterio propio.
Lo que te ofrecemos
- Rol fundacional con autonomía real sobre tu workstream.
- Contrato de prestación de servicios profesionales (freelance / Ley 20/2007), full-time o equivalente.
- Remuneración mensual competitiva ajustada a perfil senior + participación variable (phantom equity) ligada a hitos del producto. xcskxlj
- Remoto compatible: España y, bajo estructura contractual ya validada, LATAM y Portugal.