Id Perfil
3622
Perfil del Puesto
Informático, ingeniero de sistemas o bioinformático con experiencia de trabajo demostrable en desarrollo e instalación de aplicaciones. La persona contratada en el proyecto (Go-IMPaCT) PMP24/00005, participará en la creación y desarrollo de una plataforma de información genómica que permita el almacenamiento, la consulta y la compartición de datos derivados de la secuenciación de genoma completo de la cohorte IMPACT, así como los metadatos asociados en el que existan diferentes niveles de acceso para la explotación de datos. El/la candidato/a trabajará directamente con el equipo de coordinación, las entidades colaboradoras. ENTIDAD FINANCIADORA: INSTITUTO DE SALUD CARLOS III (ISCIII). PROYECTO "FINANCIADO CON CARGO A FONDOS NEXTGENERATION EU, QUE FINANCIAN LAS ACTUACIONES DEL MRR.
Provincia
MADRID
Tipo de contrato
Duración determinada programa PRTR
Financiación
Fondos Externos
Jornada completa
Si
Horas semanales
37,50
Salario
30.272,15 €
Categoría Profesional
Titulado Superior
Titulación requerida
Licenciatura o Grado+ Máster oficial (nivel MECES 3) en Bioinformática, Ingeniería Informática o Ingeniería de Telecomunicaciones. También se admitirán titulaciones en Biotecnología, Biología, Bioquímica, Ciencias Biomédicas, Farmacia o titulaciones afines, siempre que estén complementadas con un Máster oficial en Bioinformática o en tecnologías de la información aplicadas a la salud.
Id Perfil
Implementación, configuración y mantenimiento de un nodo FEGA.
Despliegue y administración de un sistema Beacon para la consulta de datos genómicos.
Desarrollo, documentación y mantenimiento de las aplicaciones utilizadas en la plataforma.
Gestión, procesamiento y análisis de datos genómicos.
Gestión de datos y metadatos para el establecimiento de un nodo Federado EGA (Federated EGA Node).
Definición e implementación de protocolos para la integración y estandarización de datos en las aplicaciones del proyecto.
Coordinación técnica con entidades colaboradoras para garantizar la interoperabilidad y el cumplimiento de los estándares del proyecto.
Experiencia requerida
Experiencia con esquemas de metadatos para la validación y organización de metadatos (json schema, etc)
Conocimiento en REST APIs.
Conocimientos de herramientas para visualización de datos (plotly, d3, matplotlib, seaborn)
Conocimientos de desarrollo web (, html, css, js)
Conocimiento de bases de datos (SQL, Apache Spark).
Conocimientos de programación orientada a objetos
Conocimientos avanzados del lenguaje de programación python.
Usuario avanzado de herramientas de trabajo cooperativo, github
Conocimientos de administración de sistemas linux
Experiencia en despliegue de aplicaciones en sistemas linux en producción.
Otros conocimientos
Se valorará positivamente:
Familiaridad con formatos y herramientas específicas del campo (VCF, FASTQ, BAM, etc.).
Experiencia en la gestión de datos de secuenciación y su integración en entornos federados como FEGA. Otros conocimientos:
Inglés
Persona organizada, proactiva, con capacidad analítica y resolutiva. Capacidad de multitarea y de adaptación a los cambios. Capacidad para trabajar tanto en equipo como de forma autónoma.